离子交换在运行过程中，如果发现软化水树脂发现颜色变深，树脂交换容量不断地下降，清洗水不断地增加，出水水质变差，周期制水容量不断地下降等现象，那么就可以认为软化水树脂受到了污染。污染原因主要有以下几种。
悬浮物引起的污染水中悬浮物质，紧裹着树脂表面的液膜层，从而隔断了树脂的离子交换过程，使树脂受到污染，这种污染以阳树脂为多。油脂引起的污染水中往往含有油类物类物质，形成膜状物，堵塞或包裹了树脂的微孔中的活基团进行离子交抽象。
有机物引起的污染有机物质在水中往往带有负电，成为阴树脂污染的主要物质。有机物主要存在于天然水中的腐殖酸，胶团的有机杂质，相对分子质量从500到5000的高分子化合物以及多元有机磷酸等，这些物质吸附在树脂上，有的占据或者结合了树脂上的活基团，有的使树脂的强碱活基团碱降低而降解，使树脂降低了离子交换能力。这类污染从COD的监测中可以检出。
再生剂不纯引起的污染软化水树脂的再生剂不纯往往混有许多杂质，龙其是烧碱(NaOH)中的杂质甚多，如Fe3+纯，NaCl，Na2CO3等，对阴树脂的污染为严重。胶体物质引起的污染水中胶体颗粒常带负离子，使阴树脂受到污染，胶体物质中以胶体硅对树脂的危害，它吸附并在漂莱特阴阳离子交换树脂的表面上聚合，阻止树脂进行离子交换。
高价金属离子引起的污染原水中的高价金属离子(如混凝剂中高价金属离子的后移等)，如A13+，Fe3+等扩散进入阳树脂的内部，同于这些高价金属离子的交换势能高，与树脂中的固定离子-SO32-牢固结合形成AL(SOFe(SO3等，从而使用这部分的固定离子失去作用，丧失了离了子交换能力。
活余氯污染：当自来水做水源水时，如残留的余氯过高>0.5毫克/升时，就会造成树脂结构的破坏此时，树脂颜色明显透明度增加，体积，树脂强度很快急骤下降，导致树脂破碎但是树脂的交换容量初期并不降低。这种污染是不可逆转的，被活余氯污染严重的树脂，将全部报废。
水中的Ca+，Mg+被置换成Na+。当钠离子交换树脂失效之后，为恢复其交换能力，就要进行再生处理。再生剂为价廉货广的食盐溶液。再生过程反应如下：R2Ca + 2NaCl = 2RNa + CaCl2R2Mg + 2NaCl = 2RNa + MgCl2为了使您易于理解接受，以下的说法是尽量通俗的说法，与标准工具书的说法可能不尽一致（但不会出现技术错误）。
离子交换树脂是一种聚合物，带有相应的功能基团。一般情况下，常规的钠离子交换树脂带有大量的钠离子。当水中的钙镁离子含量高时，离子交换树脂可以释放出钠离子，功能基团与钙镁离子结合，这样水中的钙镁离子含量降低，水的硬度下降。硬水就变为软水，这是软化水设备的工作过程。
当树脂上的大量功能基团与钙镁离子结合后，树脂的软化能力下降，可以用溶液流过树脂，此时溶液中的钠离子含量高，功能基团会释放出钙镁离子而与钠离子结合，这样树脂就恢复了交换能力，这个过程叫作“再生”。由于实际工作的需要， 软化水设备的标准工作流程主要包括。