甲醇与氯不易发生反应，但易与其水溶液作用，*初生成二氯甲醚(CH2Cl)2O，因水的作用转变成HCHO与HCl;吸入浓的甲醇蒸气时，除了特有的症状酩酊、头痛以外，常使视力模糊而眼痛。这些症状有的在数小时之后即能发生，重症时，呈现眩晕、呼吸困难、胃痛、疝痛、便秘，有时还会有出血，需要数日才恢复。在这期间也能引起疲劳、不适，重症时能出现发绀。不论急性、慢性都需要较长时间才能恢复。工作场所空气中甲醇蒸气*高容许浓度260mg/m3。
甲醇具有较强的清洗作用，汽油车在改装甲醇燃料，使用初期时，会将原来附着在油箱壁上或沉积在油箱底部的铁锈、胶质颗粒、油污等杂志清洗下来 ，漂浮或混入燃料中。这些杂质，在汽油泵长期运转下会被带入油路中。极易造成油管路，滤清器，喷油嘴的堵塞。因此，在甲醇汽车改装前，应先彻底的清洗一下汽车的燃油系统。