此套反渗透系统的污染物主要是有机物、胶体和微生物等物质，但污染不很严重，化学清洗的标准是产水流量降幅在10%左右的时候，就要进行化学清洗了，如果产水量降幅没有达到10%的时候也要进行维护性清洗，总的来说平均清洗周期约3个月。由于系统污染的原因是有机物和碳酸钙结垢，所以清洗的药剂选择上也主要是针对这些污染物，洗以复配药剂为主，复配药剂的组成为：NaOH(氢氧化钠)+Na-
 SDS(十二烷基ben磺酸钠)等药剂，pH为12左右，清洗时间为6h左右;酸洗的清洗液为HCl(盐酸)，pH 
为2~3，清洗时间为1h，清洗液的温度为30℃;最后系统用非氧化性杀菌剂DBNPA进行杀菌清洗处理。系统清洗时进行单段清洗，每段都分三段流速进行清洗：开始的时候单支膜壳流速在5mm3/h(jian洗1h，酸洗为10min);然后单支膜壳清洗液流量为5mm3/h左右进行循环清洗(洗4.5h，酸洗40min的功能);最后用大流量进行冲洗，流量在10mm3/h左右(洗0.5h，洗10min)。每次化学清洗后开启纯水泵进行冲洗，直至清洗液被纯水冲出为止。