甲基环己烷是一种良好的溶剂，可以和大部分涂料用溶剂混溶。对油脂、橡胶、蜡以及纤维素等高分子物都有一定的溶解性。

甲基环己烷主要用于制造甲基环己醇、甲基环己酮，在涂料工业中广泛用作溶剂。甲基环己烷作溶剂毒性小，挥发度适中。溶解性类似环己烷。甲基环己烷还被用作色谱分析标准物质，以及作为校正温度计的标准，也用于有机合成。