昭通居于云岭高原与四川盆地的结合部，东侧紧邻贵州省威宁县（毕节地区），南侧紧邻云南曲靖市，西侧紧邻四川凉山彝族自治州以金沙江为界相邻，北侧紧邻四川宜宾市以金沙江为界相邻。国土面积2.3万平方公里。[3]

昭通地势西南高、东北低，属典型的山地构造地形，山高谷深。市内平均海拔1685米，其中市政府驻地海拔1920米，最高海拔4040米（巧家县药山），最低海拔267米（水富县滚坎坝）。

昭通境内群山林立，海拔差异较大，具有高原季风立体气候特征。昭通境内四季差异较小，但是不同的海拔上气候有着较大的差异，海拔从高到低有高原气候、温带气候、亚热带气候之分，而在同一海拔上，昭通南部温度比北部高，湿度比北部低。

昭通全年平均气温在11℃-21℃之间，最冷气温出现在1月，月平均气温在1℃-12℃之间，最热温度出现在7月，月平均气温在20℃-27℃之间。昭通降水比较丰富，但是南北分布不均，南干北湿，涝灾和旱灾时有发生。